С началом гражданской войны белогвардейцам удалось временно захватить значительные территории Казахстана. Большевики вынуждены были уйти в подполье, откуда организовывали борьбу против контрреволюции. В этих нелегких условиях многие партийные организации не распались. В глубокой подполье они формировали партийные ячейки и группы (пятерки, семерки и т. д.). В новых условиях парторганизации меняли свою тактику и конкретную деятельность. С лета 1918 г. начали свою деятельность партийные группы и организации в Петропавловске, Акмолинске, Семипалатинске, Павлодаре, Кустанае, Усть-Каменогорске, во многих селах и аулах. Партия направила для укрепления подпольных организаций ряд опытных работников. Например, в Петропавловскую организацию вошли прибывшие из Центра семь агитаторов-организато-ров. В Акмолинской, Семипалатинской областях, Кустанайском уезде и ряде других мест работали посланцы Сибирского и Уральского обкомов партии. Большую помощь в налаживании агитационнопропагандистской работы в условиях подполья Семипалатинской организации, например, оказывали большевики Н. Г. Калашников, М. С. Сиротин, Н. Д. Некрасов, Н. П. Кузнецов, М. Н. Соломоденко. Вместе с местными коммунистами они создали в городе несколько партийных групп. В этот же период здесь была образована подпольная большевистская латышская группа во главе с Р. X. Макстысом. Среди речников вела работу боевая большевистская матросская организация.

 

В Петропавловске большевистские ячейки функционировали на железнодорожной станции, консервном и кожевенном заводах, в лагере военнопленных. Большевики Западного Казахстана сформировали Зауральный (Богдановский) подпольный райком РКП (б), который осуществлял руководство партячейками в поселках: Долинном, Придорожном, Алексеевке, Покатиловке, а также в аулах Караобинской волости Уральского уезда. Райком провел четыре съезда и действовал с сентября 1918 г. по март 1919 г. Большевистское подполье действовало и в Кустанайском уезде, и в Акмолинской области.

 

Благодаря их усилиям в тылу белогвардейцев были организованы несколько крупных восстаний — Кустанайское, Мариинское, Шемонаихинское, действовали партизанские отряды в Восточном Казахстане. 399 дней и ночей сдерживали белогвардейцев герои Черкасской обороны. Действиями Красной Армии и партизан главные силы контрреволюции были разгромлены. В освобожденных районах Казахстана сразу же началось восстановление партийных организаций.